L'obra Ciència de la creu ofereix al lector una visió àmplia, profunda i de conjunt, tant de la vida com de l'obra i la doctrina de Joan de la Creu. En la primera part, l'autora es proposa de descobrir com la vida del sant es va anar configurant i fent permeable amb el missatge de la Creu. En la segona part, ofereix una lectura unificada de totes les grans obres de Joan de la Creu i assaja de descobrir-hi una doctrina viva d'allò que significa el seguiment de Crist. En la tercera, pretén fer veure com, en aquest cas, vida i doctrina caminen plenament unides, i l'una és reflex de l'altra. Edith Stein no es proposa interpretar l'obra santjoanista en el sentit estricte de la paraula. El respecte profund, l'admiració i la sintonia que la uneixen amb Joan de la Creu són la raó per la qual opta més per una metodologia expositiva. Tanmateix, és cert que aconsegueix oferir les bases d'una teologia de la creu que ja quedava plasmada en l'esquema tripartit de l'obra: missatge, doctrina i seguiment de la creu. Un dels aspectes més originals d'aquesta obra és la presència de molts elements de caràcter antropològic que són el resultat de tota una vida dedicada a la investigació i comprensió de l'estructura de la persona humana.